Na základě modelu Panigale V2 je tato verze jedinečná díky speciálnímu zbarvení, inspirované modelem 996 R, na kterém Bayliss získal svůj první titul mistra světa v roce 2001. Motocykl je vybaven prestižními komponenty Öhlins, které přinášejí výkonnost modelu PANIGALE V2 BAYLISS 1ST CHAMPION 20TH ANNIVERSARY na zcela novou úroveň.
Znalci z názvu odhalí, že Panigale V2 pohání dvouválcový motor Superquadro 955 ccm, který prošel modernizací. Motor dosahuje výkonu 155 hp při 10 750 otáčkách a kroutící moment 104 Nm již při 9 000 otáčkách. Nově splňuje normu Euro 5.
Panigale V2 má oproti předchozí 959 revidovanou ergonomii, zaměřenou na zvýšení pohodlí. Sedlo je o 5mm více polstrované, nový tvar sedla umožňuje více podélného pohybu jezdce.